АО «НИИ «Нептун» является организацией Дивизиона «АСУ» Холдинговой компании АО «ОПК» Госкорпорации «Ростех».
За годы своей деятельности НИИ «Нептун» накопил уникальный опыт по комплексированию средств связи кораблей, судов, береговых объектов и выработал оптимальный подход к разработке эффективных систем и средств связи специального назначения.
Основными партнерами АО «НИИ «Нептун» являются Береговая охрана Пограничной службы ФСБ России, МО РФ (ВМФ).